查閱文獻(xiàn)是了解科研進(jìn)展最重要的途徑。在科研選題和規(guī)劃時,對研究項目的歷史和現(xiàn)狀,作全面查詢,了解前人已經(jīng)做過的工作、取得的進(jìn)展、成功的經(jīng)驗和失敗的教訓(xùn),提出尚需探索的問題,同時避免和少走彎路減少重復(fù)性勞動,確保...[繼續(xù)閱讀]

    3.2.1.1中國期刊網(wǎng)全文數(shù)據(jù)庫(CJFD)CJFD(網(wǎng)址:http://www.cnki.net/index.htm)是由清華大學(xué)等主辦的,目前世界上最大的連續(xù)動態(tài)更新的中國期刊全文數(shù)據(jù)庫,收集了1994年以來國內(nèi)公開出版的5300種核心期刊與專業(yè)特色期刊的全文,擁有全文文獻(xiàn)6...[繼續(xù)閱讀]

    3.2.2.1PubMed簡介PubMed(網(wǎng)址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed)是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)開發(fā)的基于網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的查詢系統(tǒng),可以免費(fèi)查詢MEDLINE、OLDMEDLINE以及其他相關(guān)的數(shù)據(jù)庫。截至2004年10月,PubMed中共收錄了4465本期刊雜志,包括...[繼續(xù)閱讀]

    為有效地管理和利用參考文獻(xiàn),美國ISIResearchSoft公司制作發(fā)行了三個商業(yè)軟件:EndNote、ReferenceManager和ProCite,研究人員可根據(jù)自己的喜好選擇使用。文獻(xiàn)管理器的主要功能:●可直接連接Internet進(jìn)行文獻(xiàn)檢索,下載參考文獻(xiàn)記錄,包括作者、...[繼續(xù)閱讀]

    3.4.1.1dbEST簡介dbEST(網(wǎng)址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/index.html)是目前最大的一個公共功能性序列數(shù)據(jù)庫,是由NCBI于1992年開發(fā)的專門用于收集各個研究組織遞交的EST數(shù)據(jù)。截至到2004年10月15日,該數(shù)據(jù)庫中已有760多個物種的24,103,541條EST序列...[繼續(xù)閱讀]

    由于一個基因表達(dá)出的mRNA有很多,由此產(chǎn)生的EST數(shù)據(jù)就有非常大的冗余,為了解決冗余和重疊的問題,NCBI的科學(xué)家們開發(fā)了UniGene數(shù)據(jù)庫(網(wǎng)址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene)。UniGene自動地把GenBank中的序列分類,變成一個非冗...[繼續(xù)閱讀]

    1.http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_tutorial/m1001.html2.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/journals/noprov/loftext_full_noprov.html3.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/dbEST_summary.html4.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=unigene5.http://ww...[繼續(xù)閱讀]

    大規(guī)模測序得到原始的EST序列要先經(jīng)過序列前處理。序列前處理是將原始序列中可能存在的污染、載體序列以及那些不考慮分析的序列(如線粒體、葉綠體、rRNA等)進(jìn)行標(biāo)記和屏蔽,使分析的序列比較“干凈”;該步驟通常采用序列比對...[繼續(xù)閱讀]

    Phrap是一個基于swat算法,對霰彈法測序的DNA序列來進(jìn)行組裝的軟件,在Unix的操作系統(tǒng)下運(yùn)行。它的獨(dú)特之處在于有較高的精確度,可以利用整個reads,而不僅僅是修整過的高質(zhì)量的部分來組裝;它尋找序列間的重疊(overlap)部分,將高質(zhì)量嵌...[繼續(xù)閱讀]

    CAP3是一個應(yīng)用于序列組裝的程序,屬第3代的CAP組裝軟件,較以前的版本有了一些改進(jìn):它能消除3′和5′端的低質(zhì)量區(qū)域;在計算read之間的重疊時使用堿基質(zhì)量信息來構(gòu)建多序列的聯(lián)配,從而產(chǎn)生一致序列,也可以利用正反向的關(guān)系確認(rèn)和...[繼續(xù)閱讀]