基于圖注意力堆疊自編碼器微生物-藥物關(guān)聯(lián)預(yù)測(cè)
摘要: 傳統(tǒng)方法發(fā)掘微生物與藥物新關(guān)聯(lián)主要通過(guò)生物實(shí)驗(yàn)完成,耗費(fèi)時(shí)間且開(kāi)銷極大?;诖耍岢龌趫D注意力堆疊自編碼器微生物與藥物關(guān)聯(lián)預(yù)測(cè)方法 GATSAE。建立微生物與藥物異構(gòu)網(wǎng)絡(luò),豐富關(guān)聯(lián)信息;通過(guò)圖卷積網(wǎng)絡(luò)(GCN)提取多層潛在特征,得到微生物和藥物的卷積融合矩陣;采用改進(jìn)的堆疊自編碼器學(xué)習(xí)有意義的高階相似特征的無(wú)監(jiān)督低維表示,在堆疊自編碼器的基礎(chǔ)上追加圖卷積和注意力機(jī)制,進(jìn)一步優(yōu)... (共12頁(yè))
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