基于轉(zhuǎn)錄組分析金魚(yú)鰓抗多子小瓜蟲(chóng)免疫應(yīng)答
摘要: 為探明多子小瓜蟲(chóng)宿主抗感染免疫機(jī)制,通過(guò)比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析了金魚(yú)抗多子小瓜蟲(chóng)感染的免疫相關(guān)基因及通路,為該病防控提供理論依據(jù)。應(yīng)用自然感染宿主的多子小瓜蟲(chóng)掠食體建立金魚(yú)感染模型,采集感染后7 d的鰓組織進(jìn)行Illumina高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和數(shù)據(jù)分析,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)10個(gè)免疫相關(guān)基因評(píng)價(jià)測(cè)序質(zhì)量。結(jié)果顯示:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得38.8 Gb測(cè)序數(shù)據(jù),注釋5178個(gè)新轉(zhuǎn)錄本,鑒... (共16頁(yè))
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